Die Wissenschaft hinter FCU-Systemen nutzt grundlegende Prinzipien der Physik, insbesondere die Gesetze der Thermodynamik, die Prozesse im Zusammenhang mit der Wärmeübertragung wie Leitung und Konvektion regeln. Die Wärmeaufnahme erfolgt durch die Spule, wenn das Kältemittel verdampft und im Kühlmodus abkühlt.
Was die praktischen Auswirkungen betrifft, verfügt das FCU-System über eine Luft- und Kältemittelbewegung. Im Kühlmodus nimmt er wärmere Luft aus diesem Raum auf und bläst sie über die Spule. Daher entzieht das Kältemittel der Luft Wärme und kühlt sie so ab.
Diese kühle Luft wird dann in den Raum zurückgeführt und kühlt ihn effektiv. Im Heizbetrieb erfolgt jedoch der umgekehrte Vorgang. Durch die Spule wird dem Kältemittel Wärme entzogen und an die Luft übertragen, wodurch diese erwärmt wird, bevor sie wieder an den Raum abgegeben wird.